made by pyLODE 2.12.0

Cell Ontology

Metadata

URI
http://purl.obolibrary.org/obo/cl.owl
Contributor(s)
Alexander Diehl
Ceri van Slyke
Chris Mungall
David Osumi-Sutherland
Jim Balhoff
Melissa Haendel
Nicole Vasilevsky
Terry Meehan
Yvonne Bradford
Version Information
2021-11-25
Version URI
http://purl.obolibrary.org/obo/cl/releases/2021-11-25/cl.owl
License
http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
Ontology RDF
RDF (turtle)

Description

See PMID:15693950, PMID:12799354, PMID:20123131, PMID:21208450; Contact Alexander Diehl, addiehl@buffalo.edu, University at Buffalo.

Table of Contents

  1. Classes
  2. Object Properties
  3. Annotation Properties
  4. Namespaces
  5. Legend

Overview

Pictures say 1,000 words
Figure 1: Ontology overview

Classes

entityc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/BFO_0000001
Sub-classes obo:BFO_0000002c
obo:BFO_0000003c

continuantc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/BFO_0000002
Super-classes obo:BFO_0000001c
Restrictions obo:BFO_0000050op only obo:BFO_0000002c
Sub-classes obo:BFO_0000004c
obo:BFO_0000031c
obo:BFO_0000020c
In domain of obo:RO_0002330op
obo:RO_0002206op
obo:RO_0000056op
obo:RO_0002258op
obo:RO_0002566op
obo:RO_0002506op
In range of obo:RO_0002506op
obo:RO_0002330op
obo:RO_0000057op
obo:RO_0002258op
obo:RO_0002566op

occurrentc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/BFO_0000003
Super-classes obo:BFO_0000001c
Restrictions obo:BFO_0000050op only obo:BFO_0000003c
Sub-classes obo:UBERON_0000000c
obo:BFO_0000015c
In domain of obo:BFO_0000062op
obo:RO_0002222op
obo:RO_0002501op
obo:BFO_0000063op
obo:RO_0002479op
obo:RO_0000057op
obo:BFO_0000066op
In range of obo:RO_0002501op
obo:BFO_0000063op
obo:RO_0002222op
obo:BFO_0000062op
obo:RO_0002487op
obo:RO_0000056op

independent continuantc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/BFO_0000004
Super-classes obo:BFO_0000002c
Restrictions obo:BFO_0000050op only obo:BFO_0000004c
Sub-classes obo:BFO_0000040c
obo:CARO_0030000c
obo:UBERON_0001062c
obo:BFO_0000141c
In domain of obo:RO_0000087op
obo:RO_0000091op
obo:RO_0002220op
obo:RO_0002150op
obo:RO_0002215op
obo:RO_0002202op
obo:RO_0000085op
obo:RO_0002176op
obo:RO_0001025op
obo:RO_0002487op
In range of obo:RO_0002150op
obo:RO_0002231op
obo:RO_0002202op
obo:RO_0002479op
obo:RO_0002232op
obo:RO_0001018op
obo:RO_0002220op
obo:RO_0001025op
obo:BFO_0000066op

spatial regionc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/BFO_0000006
Super-classes obo:BFO_0000141c

processc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/BFO_0000015
Super-classes obo:BFO_0000003c
Sub-classes obo:GO_0003674c
obo:GO_0008150c
In domain of obo:RO_0002334op
obo:RO_0002232op
obo:RO_0002018op
obo:RO_0002211op
obo:RO_0002231op
obo:RO_0002233op
In range of obo:RO_0002211op
obo:RO_0002018op
obo:RO_0002595op
obo:RO_0002334op
obo:RO_0002215op

dispositionc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/BFO_0000016
Super-classes obo:BFO_0000017c
Sub-classes obo:BFO_0000034c
In range of obo:RO_0000091op

realizable entityc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/BFO_0000017
Super-classes obo:BFO_0000020c
Restrictions obo:BFO_0000050op only obo:BFO_0000017c
Sub-classes obo:BFO_0000016c
obo:BFO_0000023c

qualityc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/BFO_0000019
Super-classes obo:BFO_0000020c
Restrictions obo:BFO_0000050op only obo:BFO_0000019c
Sub-classes obo:SO_0000010c
obo:PATO_0001241c
In range of obo:RO_0000086op

specifically dependent continuantc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/BFO_0000020
Super-classes obo:BFO_0000002c
Restrictions obo:BFO_0000050op only obo:BFO_0000020c
Sub-classes obo:BFO_0000019c
obo:BFO_0000017c
obo:PATO_0000001c
In range of obo:RO_0000053op

rolec # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/BFO_0000023
Super-classes obo:BFO_0000017c
In range of obo:RO_0000087op

fiat object partc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/BFO_0000024
Super-classes obo:BFO_0000040c
Sub-classes obo:PR_000021935c

objectc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/BFO_0000030
Super-classes obo:BFO_0000040c
Sub-classes obo:CHEBI_24431c
obo:OBI_0100026c

generically dependent continuantc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/BFO_0000031
Super-classes obo:BFO_0000002c
Restrictions obo:BFO_0000050op only obo:BFO_0000031c

functionc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/BFO_0000034
Super-classes obo:BFO_0000016c
In domain of obo:RO_0000079op
In range of obo:RO_0000085op

material entityc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/BFO_0000040
Super-classes obo:BFO_0000004c
Sub-classes obo:CARO_0001010c
obo:CARO_0000006c
obo:UBERON_0002049c
obo:CHEBI_36342c
obo:UBERON_0009142c
obo:UBERON_0000465c
obo:UBERON_0011143c
obo:BFO_0000030c
obo:BFO_0000024c
obo:UBERON_0005162c
obo:UBERON_0001556c
obo:RO_0002577c
obo:UBERON_0002303c
obo:NCBITaxon_1c
In domain of obo:RO_0002473op
obo:RO_0002595op
obo:RO_0002434op
obo:RO_0002450op
obo:RO_0002448op
obo:RO_0002375op
obo:RO_0003000op
obo:RO_0002002op
obo:RO_0001018op
obo:RO_0011002op
obo:RO_0003001op
obo:RO_0002449op
In range of obo:RO_0002434op
obo:RO_0002450op
obo:RO_0002473op
obo:RO_0002571op
obo:RO_0002448op
obo:RO_0002375op
obo:RO_0003000op
obo:RO_0002007op
obo:RO_0011002op
obo:RO_0003001op
obo:RO_0002449op

immaterial entityc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/BFO_0000141
Super-classes obo:BFO_0000004c
Sub-classes obo:UBERON_0000466c
obo:BFO_0000006c
In domain of obo:RO_0002572op
In range of obo:RO_0002002op

anatomical entityc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/CARO_0000000
Super-classes obo:CARO_0030000c
Sub-classes obo:UBERON_0010039c
obo:UBERON_0002337c
obo:UBERON_0002329c
obo:UBERON_0000045c
obo:UBERON_0009715c
obo:UBERON_0006682c
obo:UBERON_0011773c
obo:UBERON_0004716c
obo:UBERON_0009618c
obo:UBERON_0004921c
obo:UBERON_0003068c
obo:UBERON_0006206c
obo:UBERON_0012249c
obo:UBERON_0001758c
obo:UBERON_0002402c
obo:UBERON_0000407c
obo:UBERON_0001307c
obo:UBERON_0005207c
obo:UBERON_0009914c
obo:UBERON_0011241c
obo:UBERON_0000102c
obo:UBERON_0007844c
obo:UBERON_0001474c
obo:UBERON_0001230c
obo:UBERON_0010083c
obo:UBERON_0001473c
obo:UBERON_0005629c
obo:UBERON_0003218c
obo:UBERON_0015155c
obo:UBERON_0004200c
obo:UBERON_0002323c
obo:UBERON_0007144c
obo:UBERON_0004455c
obo:UBERON_0000073c
obo:UBERON_0009745c
obo:UBERON_0003076c
obo:UBERON_0000002c
obo:UBERON_0011142c
obo:UBERON_0006614c
obo:UBERON_0015179c
obo:UBERON_0002294c
obo:UBERON_0016611c
obo:UBERON_0003566c
obo:UBERON_0011215c
obo:UBERON_0002224c
obo:UBERON_0001294c
obo:UBERON_0008846c
obo:UBERON_0004706c
obo:UBERON_0000478c
obo:UBERON_0004199c
obo:UBERON_0008814c
obo:UBERON_0010210c
obo:UBERON_0034995c
obo:UBERON_0017163c
obo:UBERON_0003110c
obo:UBERON_0004914c
obo:UBERON_0002407c
obo:UBERON_0007303c
obo:UBERON_0004341c
obo:UBERON_0008203c
obo:UBERON_0012239c
obo:UBERON_0013769c
obo:UBERON_0000304c
obo:UBERON_0003579c
obo:UBERON_0016612c
obo:UBERON_0016502c
obo:UBERON_0004290c
obo:UBERON_0013758c
obo:UBERON_0003112c
obo:UBERON_0002007c
obo:UBERON_0003886c
obo:UBERON_0011769c
obo:UBERON_0005625c
obo:UBERON_0006235c
obo:UBERON_0005913c
obo:UBERON_0001731c
obo:UBERON_0016887c
obo:UBERON_0009714c
obo:UBERON_0000307c
obo:UBERON_0009744c
obo:UBERON_0001232c
obo:UBERON_0001749c
obo:UBERON_0013631c
obo:UBERON_0006877c
obo:UBERON_0010312c
obo:UBERON_0000420c
obo:UBERON_0000975c
obo:UBERON_0005334c
obo:UBERON_0006232c
obo:UBERON_0006227c
obo:UBERON_0001555c
obo:UBERON_0002268c
obo:UBERON_0009974c
obo:UBERON_0014790c
obo:UBERON_0006815c
obo:UBERON_0004026c
obo:UBERON_0005597c
obo:UBERON_0018543c
obo:UBERON_0008281c
obo:UBERON_0016517c
obo:UBERON_0000355c
obo:UBERON_0004100c
obo:UBERON_0004120c
obo:UBERON_0006692c
obo:UBERON_0003082c
obo:UBERON_0015059c
obo:UBERON_0002416c
obo:UBERON_0006553c
obo:UBERON_0006312c
obo:UBERON_0002204c
obo:UBERON_0002113c
obo:UBERON_0007367c
obo:UBERON_0012650c
obo:UBERON_0003887c
obo:UBERON_0036262c
obo:UBERON_0005944c
obo:UBERON_0035480c
obo:UBERON_0007238c
obo:UBERON_0000458c
obo:UBERON_0012480c
obo:UBERON_0002203c
obo:UBERON_0002410c
obo:UBERON_0003855c
obo:UBERON_0035763c
obo:UBERON_0009572c
obo:UBERON_0014903c
obo:UBERON_0003842c
obo:UBERON_0002278c
obo:UBERON_0004873c
obo:UBERON_0004208c
obo:UBERON_0004535c
obo:UBERON_0000162c
obo:UBERON_0004067c
obo:UBERON_0013727c
obo:UBERON_0005212c
obo:UBERON_0013191c
obo:UBERON_0004068c
obo:UBERON_0000995c
obo:UBERON_0000122c
obo:UBERON_0014950c
obo:UBERON_0000315c
obo:UBERON_8410032c
obo:UBERON_0002213c
obo:UBERON_0007689c
obo:UBERON_0004203c
obo:UBERON_0007807c
obo:UBERON_0003063c
obo:UBERON_0015019c
obo:UBERON_0006934c
obo:UBERON_0006965c
obo:UBERON_0023879c
obo:UBERON_0006224c
obo:UBERON_0002015c
obo:UBERON_0002090c
obo:UBERON_0001229c
obo:UBERON_0001264c
obo:UBERON_0011143c
obo:UBERON_0003084c
obo:UBERON_0011757c
obo:UBERON_0000013c
obo:UBERON_0000328c
obo:UBERON_0000990c
obo:UBERON_0000475c
obo:UBERON_0005215c
obo:UBERON_0002523c
obo:UBERON_0002359c
obo:UBERON_0000088c
obo:UBERON_0000091c
obo:UBERON_0009503c
obo:UBERON_0005906c
obo:UBERON_0034928c
obo:UBERON_0003929c
obo:UBERON_0010905c
obo:UBERON_0004734c
obo:UBERON_0007845c
obo:UBERON_0010133c
obo:UBERON_0007352c
obo:UBERON_0004062c
obo:UBERON_0000087c
obo:UBERON_0001484c
obo:UBERON_0006833c
obo:UBERON_0004875c
obo:UBERON_0012465c
obo:UBERON_0010204c
obo:UBERON_0003408c
obo:UBERON_0001837c
obo:UBERON_0006217c
obo:UBERON_0000403c
obo:UBERON_0001285c