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Zebrafish Experimental Conditions Ontology

Metadata

URI
http://purl.obolibrary.org/obo/zeco.owl
Version Information
2021-06-04
Version URI
http://purl.obolibrary.org/obo/zeco/releases/2021-06-04/zeco.owl
License
https://creativecommons.org/licenses/by/3.0/
Ontology RDF
RDF (turtle)

Description

Ontology of Zebrafish Experimental Conditions

Table of Contents

  1. Classes
  2. Object Properties
  3. Annotation Properties
  4. Namespaces
  5. Legend

Overview

Pictures say 1,000 words
Figure 1: Ontology overview

Classes ↑

conditionsc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000100
Sub-classes obo:ZECO_0000101c
obo:ZECO_0000104c
obo:ZECO_0000103c

control conditionsc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000101
Super-classes obo:ZECO_0000100c
Sub-classes obo:ZECO_0000102c

generic controlc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000102
Super-classes obo:ZECO_0000101c

standard conditionsc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000103
Super-classes obo:ZECO_0000100c

experimental conditionsc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000104
Super-classes obo:ZECO_0000100c
Sub-classes obo:ZECO_0000208c
obo:ZECO_0000222c
obo:ZECO_0000160c
obo:ZECO_0000154c
obo:ZECO_0000113c
obo:ZECO_0000131c
obo:ZECO_0000105c
obo:ZECO_0000111c
obo:ZECO_0000146c
obo:ZECO_0000140c
obo:ZECO_0000182c
obo:ZECO_0000252c
obo:ZECO_0000143c
obo:ZECO_0000112c
obo:ZECO_0000229c

biological treatmentc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000105
Super-classes obo:ZECO_0000104c
Sub-classes obo:ZECO_0000108c
obo:ZECO_0000107c
obo:ZECO_0000106c
obo:ZECO_0000109c
obo:ZECO_0000173c
obo:ZECO_0000110c
obo:ZECO_0000177c

bacterial treatmentc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000106
Super-classes obo:ZECO_0000105c
Sub-classes obo:ZECO_0000231c
obo:ZECO_0000254c
obo:ZECO_0000256c
obo:ZECO_0000230c

fungal treatmentc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000107
Super-classes obo:ZECO_0000105c
Sub-classes obo:ZECO_0000233c
obo:ZECO_0000232c

germ freec # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000108
Super-classes obo:ZECO_0000105c

protozoan treatmentc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000109
Super-classes obo:ZECO_0000105c

viral treatmentc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000110
Super-classes obo:ZECO_0000105c
Sub-classes obo:ZECO_0000235c
obo:ZECO_0000234c

chemical treatmentc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000111
Super-classes obo:ZECO_0000104c
Sub-classes obo:ZECO_0000238c
obo:ZECO_0000255c
obo:ZECO_0000237c
obo:ZECO_0000239c

dietc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000112
Super-classes obo:ZECO_0000104c
Sub-classes obo:ZECO_0000117c
obo:ZECO_0000239c

food availabilityc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000113
Super-classes obo:ZECO_0000104c
Sub-classes obo:ZECO_0000115c
obo:ZECO_0000247c

fastingc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000114
Super-classes obo:ZECO_0000115c

limited food availabilityc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000115
Super-classes obo:ZECO_0000113c
Sub-classes obo:ZECO_0000114c

unlimited food availabilityc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000116
Super-classes obo:ZECO_0000247c

food contentc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000117
Super-classes obo:ZECO_0000112c
Sub-classes obo:ZECO_0000262c
obo:ZECO_0000250c
obo:ZECO_0000128c
obo:ZECO_0000240c
obo:ZECO_0000118c
obo:ZECO_0000121c
obo:ZECO_0000251c

cholesterol contentc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000118
Super-classes obo:ZECO_0000117c
Sub-classes obo:ZECO_0000119c
obo:ZECO_0000120c

high cholesterolc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000119
Super-classes obo:ZECO_0000118c

low cholesterolc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000120
Super-classes obo:ZECO_0000118c

fat contentc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000121
Super-classes obo:ZECO_0000117c
Sub-classes obo:ZECO_0000122c
obo:ZECO_0000125c

high fatc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000122
Super-classes obo:ZECO_0000121c
obo:ZECO_0000251c
Sub-classes obo:ZECO_0000226c
obo:ZECO_0000225c
obo:ZECO_0000124c
obo:ZECO_0000123c

high saturated fatc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000123
Super-classes obo:ZECO_0000122c

high monounsaturated fatc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000124
Super-classes obo:ZECO_0000122c

low fatc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000125
Super-classes obo:ZECO_0000250c
obo:ZECO_0000121c
Sub-classes obo:ZECO_0000228c
obo:ZECO_0000227c
obo:ZECO_0000126c
obo:ZECO_0000127c

low trans fatc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000126
Super-classes obo:ZECO_0000125c

low polyunsaturated fatc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000127
Super-classes obo:ZECO_0000125c

protein contentc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000128
Super-classes obo:ZECO_0000117c
Sub-classes obo:ZECO_0000129c
obo:ZECO_0000130c

high proteinc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000129
Super-classes obo:ZECO_0000128c
obo:ZECO_0000251c

low proteinc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000130
Super-classes obo:ZECO_0000128c
obo:ZECO_0000250c

stressc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000131
Super-classes obo:ZECO_0000104c
Sub-classes obo:ZECO_0000243c
obo:ZECO_0000155c

high sugarc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000132
Super-classes obo:ZECO_0000241c
Sub-classes obo:ZECO_0000133c
obo:ZECO_0000135c
obo:ZECO_0000134c

high fructosec # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000133
Super-classes obo:ZECO_0000132c

high glucosec # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000134
Super-classes obo:ZECO_0000132c

high sucrosec # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000135
Super-classes obo:ZECO_0000132c

low sugarc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000136
Super-classes obo:ZECO_0000242c
Sub-classes obo:ZECO_0000137c
obo:ZECO_0000139c
obo:ZECO_0000138c

low sucrosec # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000137
Super-classes obo:ZECO_0000136c

low fructosec # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000138
Super-classes obo:ZECO_0000136c

low glucosec # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000139
Super-classes obo:ZECO_0000136c

housing conditionsc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000140
Super-classes obo:ZECO_0000104c
Sub-classes obo:ZECO_0000142c
obo:ZECO_0000141c
obo:ZECO_0000246c

open roofedc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000141
Super-classes obo:ZECO_0000140c

overcrowdingc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000142
Super-classes obo:ZECO_0000140c

in vitro culturec # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000143
Super-classes obo:ZECO_0000104c
Sub-classes obo:ZECO_0000145c
obo:ZECO_0000144c

organ culturec # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000144
Super-classes obo:ZECO_0000143c

primary cell culturec # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000145
Super-classes obo:ZECO_0000143c

lighting conditionsc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000146
Super-classes obo:ZECO_0000104c
Sub-classes obo:ZECO_0000151c
obo:ZECO_0000147c

light durationc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000147
Super-classes obo:ZECO_0000146c
Sub-classes obo:ZECO_0000148c
obo:ZECO_0000149c
obo:ZECO_0000150c

altered light dark cyclec # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000148
Super-classes obo:ZECO_0000147c

constant darkc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000149
Super-classes obo:ZECO_0000147c

constant lightc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000150
Super-classes obo:ZECO_0000147c

light intensityc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000151
Super-classes obo:ZECO_0000146c
Sub-classes obo:ZECO_0000153c
obo:ZECO_0000152c

high light intensityc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000152
Super-classes obo:ZECO_0000151c

low light intensityc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000153
Super-classes obo:ZECO_0000151c

gravityc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000154
Super-classes obo:ZECO_0000104c
Sub-classes obo:ZECO_0000264c
obo:ZECO_0000263c

mechanical stressc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000155
Super-classes obo:ZECO_0000131c
Sub-classes obo:ZECO_0000156c
obo:ZECO_0000157c

vibrationc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000156
Super-classes obo:ZECO_0000155c
Sub-classes obo:ZECO_0000244c

water flowc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000157
Super-classes obo:ZECO_0000155c
Sub-classes obo:ZECO_0000158c
obo:ZECO_0000159c

circular flowc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000158
Super-classes obo:ZECO_0000157c

through flowc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000159
Super-classes obo:ZECO_0000157c

temperature exposurec # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000160
Super-classes obo:ZECO_0000104c
Sub-classes obo:ZECO_0000164c
obo:ZECO_0000161c

stable temperature exposurec # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000161
Super-classes obo:ZECO_0000160c
Sub-classes obo:ZECO_0000163c
obo:ZECO_0000162c

cold exposurec # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000162
Super-classes obo:ZECO_0000161c

heat exposurec # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000163
Super-classes obo:ZECO_0000161c

temperature shockc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000164
Super-classes obo:ZECO_0000160c
Sub-classes obo:ZECO_0000165c
obo:ZECO_0000166c

cold shockc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000165
Super-classes obo:ZECO_0000164c

heat shockc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000166
Super-classes obo:ZECO_0000164c

ablationc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000168
Super-classes obo:ZECO_0000229c
Sub-classes obo:ZECO_0000170c
obo:ZECO_0000169c
obo:ZECO_0000249c

chemical ablationc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000169
Super-classes obo:ZECO_0000168c

light ablationc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000170
Super-classes obo:ZECO_0000168c
obo:ZECO_0000245c

resectionc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000171
Super-classes obo:ZECO_0000176c
Sub-classes obo:ZECO_0000172c

amputationc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000172
Super-classes obo:ZECO_0000171c

vaccine treatmentc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000173
Super-classes obo:ZECO_0000105c

lacerationc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000174
Super-classes obo:ZECO_0000229c

surgical manipulationc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000176
Super-classes obo:ZECO_0000229c
Sub-classes obo:ZECO_0000181c
obo:ZECO_0000171c

xenotransplantationc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000177
Super-classes obo:ZECO_0000105c
Sub-classes obo:ZECO_0000236c

perforationc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000178
Super-classes obo:ZECO_0000229c

abrasionc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000179
Super-classes obo:ZECO_0000229c

contusionc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000180
Super-classes obo:ZECO_0000229c

transectionc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000181
Super-classes obo:ZECO_0000176c

water qualityc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000182
Super-classes obo:ZECO_0000104c
Sub-classes obo:ZECO_0000190c
obo:ZECO_0000203c
obo:ZECO_0000183c

gas compositionc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000183
Description

Water quality condition that alters the concentration of atmospheric gases in water.
Super-classes obo:ZECO_0000182c
Sub-classes obo:ZECO_0000187c
obo:ZECO_0000184c

carbon dioxide contentc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000184
Super-classes obo:ZECO_0000183c
Sub-classes obo:ZECO_0000186c
obo:ZECO_0000185c

hypercapniac # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000185
Super-classes obo:ZECO_0000184c

hypocapniac # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000186
Super-classes obo:ZECO_0000184c

oxygen contentc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000187
Super-classes obo:ZECO_0000183c
Sub-classes obo:ZECO_0000189c
obo:ZECO_0000188c

hyperoxiac # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000188
Super-classes obo:ZECO_0000187c

hypoxiac # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000189
Super-classes obo:ZECO_0000187c

ion compositionc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000190
Super-classes obo:ZECO_0000182c
Sub-classes obo:ZECO_0000200c
obo:ZECO_0000191c
obo:ZECO_0000194c
obo:ZECO_0000197c

modified calcium compositionc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000191
Super-classes obo:ZECO_0000190c
Sub-classes obo:ZECO_0000193c
obo:ZECO_0000192c

high calciumc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000192
Super-classes obo:ZECO_0000191c

low calciumc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000193
Super-classes obo:ZECO_0000191c

modified potassium compositionc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000194
Super-classes obo:ZECO_0000190c
Sub-classes obo:ZECO_0000196c
obo:ZECO_0000195c

high potassiumc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000195
Super-classes obo:ZECO_0000194c

low potassiumc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000196
Super-classes obo:ZECO_0000194c

modified sodium compositionc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000197
Super-classes obo:ZECO_0000190c
Sub-classes obo:ZECO_0000198c
obo:ZECO_0000199c

high sodiumc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000198
Super-classes obo:ZECO_0000197c

low sodiumc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000199
Super-classes obo:ZECO_0000197c

pHc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000200
Super-classes obo:ZECO_0000190c
Sub-classes obo:ZECO_0000201c
obo:ZECO_0000202c

acidicc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000201
Super-classes obo:ZECO_0000200c

basicc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000202
Super-classes obo:ZECO_0000200c

water salinityc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000203
Super-classes obo:ZECO_0000182c
Sub-classes obo:ZECO_0000206c
obo:ZECO_0000204c
obo:ZECO_0000207c
obo:ZECO_0000205c

hypertonicc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000204
Super-classes obo:ZECO_0000203c

hypotonicc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000205
Super-classes obo:ZECO_0000203c

isotonicc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000206
Super-classes obo:ZECO_0000203c

stablec # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000207
Super-classes obo:ZECO_0000203c

radiationc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000208
Super-classes obo:ZECO_0000104c
Sub-classes obo:ZECO_0000217c
obo:ZECO_0000209c
obo:ZECO_0000220c

electromagnetic radiationc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000209
Super-classes obo:ZECO_0000208c
Sub-classes obo:ZECO_0000212c
obo:ZECO_0000213c
obo:ZECO_0000211c
obo:ZECO_0000216c
obo:ZECO_0000210c
obo:ZECO_0000214c
obo:ZECO_0000215c

radio wavesc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000210
Super-classes obo:ZECO_0000209c

microwavesc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000211
Super-classes obo:ZECO_0000209c

infaredc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000212
Super-classes obo:ZECO_0000209c

visible lightc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000213
Super-classes obo:ZECO_0000209c

ultraviolet lightc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000214
Super-classes obo:ZECO_0000209c

x-rayc # Classes

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Super-classes obo:ZECO_0000209c

gamma rayc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000216
Super-classes obo:ZECO_0000209c

particle radiationc # Classes

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Super-classes obo:ZECO_0000208c
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obo:ZECO_0000221c

protonc # Classes

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acoustic radiationc # Classes

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Super-classes obo:ZECO_0000208c

alpha particlec # Classes

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Super-classes obo:ZECO_0000217c

electromagnetic fieldc # Classes

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Super-classes obo:ZECO_0000104c
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electric fieldc # Classes

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magnetic fieldc # Classes

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Super-classes obo:ZECO_0000222c

high polysunsaturated fatc # Classes

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Super-classes obo:ZECO_0000122c

high trans fatc # Classes

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Super-classes obo:ZECO_0000122c

low saturated fatc # Classes

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Super-classes obo:ZECO_0000125c

low monounsaturated fatc # Classes

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Super-classes obo:ZECO_0000125c

physical alterationc # Classes

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Super-classes obo:ZECO_0000104c
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bacterial treatment by injectionc # Classes

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Super-classes obo:ZECO_0000106c

bacterial treatment by exposure to environmentc # Classes

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Super-classes obo:ZECO_0000106c

fungal treatment by injectionc # Classes

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fungal treatment by exposure to environmentc # Classes

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viral treatment by exposure to environmentc # Classes

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viral treatment by injectionc # Classes

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cancer xenotransplantationc # Classes

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chemical treatment by injectionc # Classes

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chemical treatment by environmentc # Classes

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chemical treatment by dietc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZECO_0000239
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carbohydrate contentc # Classes

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Super-classes obo:ZECO_0000117c
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high carbohydratec # Classes

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ultrasoundc # Classes

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light damagec # Classes

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undercrowdingc # Classes

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bacterial treatment by gavagec # Classes

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bacterial treatment by dietc # Classes

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cauterizationc # Classes

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Super-classes obo:ZECO_0000229c
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Object Properties ↑

part ofop # OPs

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Inverse properties obo:BFO_0000051op

has partop # OPs

URI http://purl.obolibrary.org/obo/BFO_0000051

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Annotation Properties ↑

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definitionap # APs

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Super-properties oboInOwl:SubsetPropertyap

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Description

abstract upper-level terms not directly useful for analysis
Super-properties oboInOwl:SubsetPropertyap

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Namespaces ↑

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xsd
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Legend

cClasses
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fpFunctional Properties
dpData Properties
dpAnnotation Properties
pProperties
niNamed Individuals