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Metadata

URI
http://purl.obolibrary.org/obo/zfs.owl
Version URI
http://purl.obolibrary.org/obo/zfs/releases/2020-03-10/zfs.owl
Ontology RDF
RDF (turtle)

Table of Contents

  1. Classes
  2. Object Properties
  3. Annotation Properties
  4. Namespaces
  5. Legend

Overview

Pictures say 1,000 words
Figure 1: Ontology overview

Classes

Unknownc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZFS_0000000
Super-classes obo:ZFS_0100000c

Zygote:1-cellc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZFS_0000001
Super-classes obo:ZFS_0100000c

Cleavage:2-cellc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZFS_0000002
Super-classes obo:ZFS_0100000c
Restrictions obo:BFO_0000050op some obo:ZFS_0000046c
obo:RO_0002087op some obo:ZFS_0000001c

Cleavage:4-cellc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZFS_0000003
Super-classes obo:ZFS_0100000c
Restrictions obo:BFO_0000050op some obo:ZFS_0000046c
obo:RO_0002087op some obo:ZFS_0000002c

Cleavage:8-cellc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZFS_0000004
Super-classes obo:ZFS_0100000c
Restrictions obo:BFO_0000050op some obo:ZFS_0000046c
obo:RO_0002087op some obo:ZFS_0000003c

Cleavage:16-cellc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZFS_0000005
Super-classes obo:ZFS_0100000c
Restrictions obo:RO_0002087op some obo:ZFS_0000004c
obo:BFO_0000050op some obo:ZFS_0000046c

Cleavage:32-cellc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZFS_0000006
Super-classes obo:ZFS_0100000c
Restrictions obo:BFO_0000050op some obo:ZFS_0000046c
obo:RO_0002087op some obo:ZFS_0000005c

Cleavage:64-cellc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZFS_0000007
Super-classes obo:ZFS_0100000c
Restrictions obo:RO_0002087op some obo:ZFS_0000006c
obo:BFO_0000050op some obo:ZFS_0000046c

Blastula:128-cellc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZFS_0000008
Super-classes obo:ZFS_0100000c
Restrictions obo:BFO_0000050op some obo:ZFS_0000045c
obo:RO_0002087op some obo:ZFS_0000007c

Blastula:256-cellc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZFS_0000009
Super-classes obo:ZFS_0100000c
Restrictions obo:RO_0002087op some obo:ZFS_0000008c
obo:BFO_0000050op some obo:ZFS_0000045c

Blastula:512-cellc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZFS_0000010
Super-classes obo:ZFS_0100000c
Restrictions obo:BFO_0000050op some obo:ZFS_0000045c
obo:RO_0002087op some obo:ZFS_0000009c

Blastula:1k-cellc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZFS_0000011
Super-classes obo:ZFS_0100000c
Restrictions obo:RO_0002087op some obo:ZFS_0000010c
obo:BFO_0000050op some obo:ZFS_0000045c

Blastula:Highc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZFS_0000012
Super-classes obo:ZFS_0100000c
Restrictions obo:BFO_0000050op some obo:ZFS_0000045c
obo:RO_0002087op some obo:ZFS_0000011c

Blastula:Oblongc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZFS_0000013
Super-classes obo:ZFS_0100000c
Restrictions obo:RO_0002087op some obo:ZFS_0000012c
obo:BFO_0000050op some obo:ZFS_0000045c

Blastula:Spherec # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZFS_0000014
Super-classes obo:ZFS_0100000c
Restrictions obo:BFO_0000050op some obo:ZFS_0000045c
obo:RO_0002087op some obo:ZFS_0000013c

Blastula:Domec # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZFS_0000015
Super-classes obo:ZFS_0100000c
Restrictions obo:RO_0002087op some obo:ZFS_0000014c
obo:BFO_0000050op some obo:ZFS_0000045c

Blastula:30%-epibolyc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZFS_0000016
Super-classes obo:ZFS_0100000c
Restrictions obo:RO_0002087op some obo:ZFS_0000015c
obo:BFO_0000050op some obo:ZFS_0000045c

Gastrula:50%-epibolyc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZFS_0000017
Super-classes obo:ZFS_0100000c
Restrictions obo:RO_0002087op some obo:ZFS_0000016c
obo:BFO_0000050op some obo:ZFS_0000047c

Gastrula:Germ-ringc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZFS_0000018
Super-classes obo:ZFS_0100000c
Restrictions obo:RO_0002087op some obo:ZFS_0000017c
obo:BFO_0000050op some obo:ZFS_0000047c

Gastrula:Shieldc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZFS_0000019
Super-classes obo:ZFS_0100000c
Restrictions obo:RO_0002087op some obo:ZFS_0000018c
obo:BFO_0000050op some obo:ZFS_0000047c

Gastrula:75%-epibolyc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZFS_0000020
Super-classes obo:ZFS_0100000c
Restrictions obo:RO_0002087op some obo:ZFS_0000019c
obo:BFO_0000050op some obo:ZFS_0000047c

Gastrula:90%-epibolyc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZFS_0000021
Super-classes obo:ZFS_0100000c
Restrictions obo:RO_0002087op some obo:ZFS_0000020c
obo:BFO_0000050op some obo:ZFS_0000047c

Gastrula:Budc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZFS_0000022
Super-classes obo:ZFS_0100000c
Restrictions obo:RO_0002087op some obo:ZFS_0000021c
obo:BFO_0000050op some obo:ZFS_0000047c

Segmentation:1-4 somitesc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZFS_0000023
Super-classes obo:ZFS_0100000c
Restrictions obo:BFO_0000050op some obo:ZFS_0000049c
obo:RO_0002087op some obo:ZFS_0000022c

Segmentation:5-9 somitesc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZFS_0000024
Super-classes obo:ZFS_0100000c
Restrictions obo:BFO_0000050op some obo:ZFS_0000049c
obo:RO_0002087op some obo:ZFS_0000023c

Segmentation:10-13 somitesc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZFS_0000025
Super-classes obo:ZFS_0100000c
Restrictions obo:RO_0002087op some obo:ZFS_0000024c
obo:BFO_0000050op some obo:ZFS_0000049c

Segmentation:14-19 somitesc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZFS_0000026
Super-classes obo:ZFS_0100000c
Restrictions obo:RO_0002087op some obo:ZFS_0000025c
obo:BFO_0000050op some obo:ZFS_0000049c

Segmentation:20-25 somitesc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZFS_0000027
Super-classes obo:ZFS_0100000c
Restrictions obo:BFO_0000050op some obo:ZFS_0000049c
obo:RO_0002087op some obo:ZFS_0000026c

Segmentation:26+ somitesc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZFS_0000028
Super-classes obo:ZFS_0100000c
Restrictions obo:BFO_0000050op some obo:ZFS_0000049c
obo:RO_0002087op some obo:ZFS_0000027c

Pharyngula:Prim-5c # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZFS_0000029
Super-classes obo:ZFS_0100000c
Restrictions obo:BFO_0000050op some obo:ZFS_0000050c
obo:RO_0002087op some obo:ZFS_0000028c

Pharyngula:Prim-15c # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZFS_0000030
Super-classes obo:ZFS_0100000c
Restrictions obo:RO_0002087op some obo:ZFS_0000029c
obo:BFO_0000050op some obo:ZFS_0000050c

Pharyngula:Prim-25c # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZFS_0000031
Super-classes obo:ZFS_0100000c
Restrictions obo:BFO_0000050op some obo:ZFS_0000050c
obo:RO_0002087op some obo:ZFS_0000030c

Pharyngula:High-pecc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZFS_0000032
Super-classes obo:ZFS_0100000c
Restrictions obo:RO_0002087op some obo:ZFS_0000031c
obo:BFO_0000050op some obo:ZFS_0000050c

Hatching:Long-pecc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZFS_0000033
Super-classes obo:ZFS_0100000c
Restrictions obo:RO_0002087op some obo:ZFS_0000032c
obo:BFO_0000050op some obo:ZFS_0007000c

Hatching:Pec-finc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZFS_0000034
Super-classes obo:ZFS_0100000c
Restrictions obo:RO_0002087op some obo:ZFS_0000033c
obo:BFO_0000050op some obo:ZFS_0007000c

Larval:Protruding-mouthc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZFS_0000035
Super-classes obo:ZFS_0100000c
Restrictions obo:BFO_0000050op some obo:ZFS_0000048c
obo:RO_0002087op some obo:ZFS_0000034c

Larval:Day 4c # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZFS_0000036
Super-classes obo:ZFS_0100000c
Restrictions obo:BFO_0000050op some obo:ZFS_0000048c
obo:RO_0002087op some obo:ZFS_0000035c

Larval:Day 5c # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZFS_0000037
Super-classes obo:ZFS_0100000c
Restrictions obo:RO_0002087op some obo:ZFS_0000036c
obo:BFO_0000050op some obo:ZFS_0000048c

Larval:Day 6c # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZFS_0000038
Super-classes obo:ZFS_0100000c
Restrictions obo:RO_0002087op some obo:ZFS_0000037c
obo:BFO_0000050op some obo:ZFS_0000048c

Larval:Days 7-13c # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZFS_0000039
Super-classes obo:ZFS_0100000c
Restrictions obo:RO_0002087op some obo:ZFS_0000038c
obo:BFO_0000050op some obo:ZFS_0000048c

Larval:Days 14-20c # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZFS_0000040
Super-classes obo:ZFS_0100000c
Restrictions obo:RO_0002087op some obo:ZFS_0000039c
obo:BFO_0000050op some obo:ZFS_0000048c

Larval:Days 21-29c # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZFS_0000041
Super-classes obo:ZFS_0100000c
Restrictions obo:RO_0002087op some obo:ZFS_0000040c
obo:BFO_0000050op some obo:ZFS_0000048c

Juvenile:Days 30-44c # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZFS_0000042
Super-classes obo:ZFS_0100000c
Restrictions obo:BFO_0000050op some obo:ZFS_0000051c
obo:RO_0002087op some obo:ZFS_0000041c

Juvenile:Days 45-89c # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZFS_0000043
Super-classes obo:ZFS_0100000c
Restrictions obo:RO_0002087op some obo:ZFS_0000042c
obo:BFO_0000050op some obo:ZFS_0000051c

adultc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZFS_0000044
Super-classes obo:ZFS_0100000c
Restrictions obo:RO_0002087op some obo:ZFS_0000043c

blastulac # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZFS_0000045
Super-classes obo:ZFS_0100000c
Restrictions obo:RO_0002087op some obo:ZFS_0000046c

cleavagec # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZFS_0000046
Super-classes obo:ZFS_0100000c

gastrulac # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZFS_0000047
Super-classes obo:ZFS_0100000c
Restrictions obo:RO_0002087op some obo:ZFS_0000045c

larvac # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZFS_0000048
Super-classes obo:ZFS_0100000c
Restrictions obo:RO_0002087op some obo:ZFS_0007000c

segmentationc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZFS_0000049
Super-classes obo:ZFS_0100000c
Restrictions obo:RO_0002087op some obo:ZFS_0000047c

pharyngulac # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZFS_0000050
Super-classes obo:ZFS_0100000c
Restrictions obo:RO_0002087op some obo:ZFS_0000049c

juvenilec # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZFS_0000051
Super-classes obo:ZFS_0100000c
Restrictions obo:RO_0002087op some obo:ZFS_0000048c

hatchingc # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZFS_0007000
Super-classes obo:ZFS_0100000c
Restrictions obo:RO_0002087op some obo:ZFS_0000050c

zebrafish stagec # Classes

URI http://purl.obolibrary.org/obo/ZFS_0100000
Sub-classes obo:ZFS_0000050c
obo:ZFS_0000037c
obo:ZFS_0000002c
obo:ZFS_0000017c
obo:ZFS_0000005c
obo:ZFS_0000018c
obo:ZFS_0000031c
obo:ZFS_0000047c
obo:ZFS_0000036c
obo:ZFS_0000029c
obo:ZFS_0000012c
obo:ZFS_0000032c
obo:ZFS_0000003c
obo:ZFS_0000011c
obo:ZFS_0000051c
obo:ZFS_0000046c
obo:ZFS_0000019c
obo:ZFS_0000023c
obo:ZFS_0000010c
obo:ZFS_0000033c
obo:ZFS_0000035c
obo:ZFS_0000009c
obo:ZFS_0000038c
obo:ZFS_0000048c
obo:ZFS_0000021c
obo:ZFS_0000041c
obo:ZFS_0000045c
obo:ZFS_0000049c
obo:ZFS_0000013c
obo:ZFS_0000044c
obo:ZFS_0000006c
obo:ZFS_0000007c
obo:ZFS_0000022c
obo:ZFS_0000043c
obo:ZFS_0000008c
obo:ZFS_0000004c
obo:ZFS_0000000c
obo:ZFS_0000015c
obo:ZFS_0000001c
obo:ZFS_0000030c
obo:ZFS_0000028c
obo:ZFS_0000039c
obo:ZFS_0000027c
obo:ZFS_0000040c
obo:ZFS_0000025c
obo:ZFS_0000034c
obo:ZFS_0000016c
obo:ZFS_0000014c
obo:ZFS_0000042c
obo:ZFS_0000020c
obo:ZFS_0007000c
obo:ZFS_0000026c
obo:ZFS_0000024c

Object Properties

part ofop # OPs

URI http://purl.obolibrary.org/obo/BFO_0000050

preceded_byop # OPs

URI http://purl.obolibrary.org/obo/BFO_0000062

immediately_preceded_byop # OPs

URI http://purl.obolibrary.org/obo/RO_0002087
Super-properties obo:BFO_0000062op

Annotation Properties

definitionap # APs

URI http://purl.obolibrary.org/obo/IAO_0000115

PLURALap # APs

URI http://purl.obolibrary.org/obo/zfs#PLURAL
Super-properties oboInOwl:SynonymTypePropertyap

granular_stageap # APs

URI http://purl.obolibrary.org/obo/zfs#granular_stage
Description

Subset consisting of classes describing highly granular developmental stages (for instance, '23-year-old'). Such stages might be useful for annotation purpose, but might be folded into less granular parents for display purpose.

Super-properties oboInOwl:SubsetPropertyap

subset_propertyap # APs

URI http://www.geneontology.org/formats/oboInOwl#SubsetProperty

synonym_type_propertyap # APs

URI http://www.geneontology.org/formats/oboInOwl#SynonymTypeProperty

auto-generated-byap # APs

URI http://www.geneontology.org/formats/oboInOwl#auto-generated-by

created_byap # APs

URI http://www.geneontology.org/formats/oboInOwl#created_by

creation_dateap # APs

URI http://www.geneontology.org/formats/oboInOwl#creation_date

dateap # APs

URI http://www.geneontology.org/formats/oboInOwl#date

default-namespaceap # APs

URI http://www.geneontology.org/formats/oboInOwl#default-namespace

database_cross_referenceap # APs

URI http://www.geneontology.org/formats/oboInOwl#hasDbXref

has_obo_format_versionap # APs

URI http://www.geneontology.org/formats/oboInOwl#hasOBOFormatVersion

has_obo_namespaceap # APs

URI http://www.geneontology.org/formats/oboInOwl#hasOBONamespace

idap # APs

URI http://www.geneontology.org/formats/oboInOwl#id

saved-byap # APs

URI http://www.geneontology.org/formats/oboInOwl#saved-by

shorthandap # APs

URI http://www.geneontology.org/formats/oboInOwl#shorthand

commentap # APs

URI http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#comment

labelap # APs

URI http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#label

Namespaces

default (:)
http://purl.obolibrary.org/obo/zfs.owl
dct
http://purl.org/dc/terms/
obo
http://purl.obolibrary.org/obo/
oboInOwl
http://www.geneontology.org/formats/oboInOwl#
owl
http://www.w3.org/2002/07/owl#
prov
http://www.w3.org/ns/prov#
rdf
http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#
rdfs
http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#
sdo
https://schema.org/
skos
http://www.w3.org/2004/02/skos/core#
xsd
http://www.w3.org/2001/XMLSchema#
zfs
http://purl.obolibrary.org/obo/zfs#

Legend

cClasses
opObject Properties
fpFunctional Properties
dpData Properties
dpAnnotation Properties
pProperties
niNamed Individuals